Olimpiada organizuojama kasmet trimis etapais: mokyklos, savivaldybės ir šalies.
Šalies etapą sudaro atrankinė ir baigiamoji dalys.

Kiekvienam etapui parengiami du užduočių rinkiniai:

• 8 klasėms ir I gimnazijos klasėms (jaunesnioji grupė)
• II-IV gimnazijos klasėms (vyresnioji grupė)

Mokiniai varžosi su besimokančiais toje pačioje klasėje. Pavyzdžiui, nors II, III ir IV gimnazijų klasės sprendžia vienodas užduotis, sudaromos trys atskiros rezultatų lentelės kiekvienai klasei. 

Olimpiadoje kviečiami dalyvauti ir jaunesni nei 8 klasių mokiniai. Jie įtraukiami į aštuntų klasių dalyvių sąrašą ir varžosi kartu su aštuntokais.

Mokyklos, savivaldybės etapuose bei šalies etapo atrankinėje dalyje galima programuoti C++ ir Pitono (angl. Python) kalbomis. Tame pačiame etape galima vieną uždavinį galima spręsti viena programavimo kalbą, o kitą – kita.

Šalies etapo baigiamojoje dalyje, kuri kartu yra ir atranka į tarptautines olimpiadas, galima programuoti tik C++ programavimo kalba.

Uždaviniai rengiami laikantis LMIO dalykinės programos, kuri atitinka Tarptautinių informatikos olimpiadų (IOI) dalykinę programą.

Įprastai parengiamas trijų uždavinių rinkinys, kurį reikia išspręsti per keturias arba penkias valandas, priklausomai nuo etapo.

Praktinių uždavinių sprendimai olimpiados metu turi būti įkeliami į varžybų sistemą CMS, kuri automatiškai juos įvertina. 

Varžybų sistema olimpiados metu veikia adresu: cms.lmio.lt. Šiuo adresu sistema veikia nuo olimpiados dienos iki patvirtinami galutiniai einamojo etapo rezultatai. 

Ne olimpiados metu treniruotėms varžybų sistema veikia adresu: olimp.mif.vu.lt. 

Atkreipiame dėmesį, kad sukūrus paskyrą treniruotėje, ta pati paskyra negalioja olimpiadoje.